संशोधित रिटर्न के लिए IRS द्वारा प्रकाशित अपेक्षित प्रसंस्करण समय 16 सप्ताह है। हालाँकि, IRS करदाताओं को यह सलाह देने में विफल रहता है कि यदि उनके संशोधित रिटर्न का ऑडिट किया जाता है, तो प्रसंस्करण में काफी अधिक समय लगेगा। प्रक्रिया के चरणों में से एक, ऑडिट के लिए चुने गए संशोधित रिटर्न को परीक्षक (जो करदाता से संपर्क करता है) को सौंपना और ऑडिट खोलना, अकेले व्यक्तिगत संशोधित रिटर्न के लिए तीन से नौ सप्ताह और कॉर्पोरेट संशोधित रिटर्न के लिए 14 से 16 सप्ताह का अनुमानित औसत समय लगा। इसके अलावा, जब करदाता किसी ऐसे कर में कटौती का अनुरोध करने के लिए संशोधित रिटर्न दाखिल करते हैं जो भुगतान नहीं किया गया है, यानी, छूट के लिए अनुरोध, तो IRS कभी-कभी दावे पर विचार करने से इनकार कर देता है और करदाता को पर्याप्त स्पष्टीकरण दिए बिना दावे को खारिज करने वाला एक फॉर्म पत्र जारी करता है। हालाँकि IRS के पास इन दावों पर विचार करने का अधिकार है, लेकिन फॉर्म पत्र में केवल यह कहा गया है कि कानून बकाया कर को कम करने के लिए दावे की अनुमति नहीं देता है और करदाता को कर का भुगतान करने के बाद एक और संशोधित रिटर्न दाखिल करने का निर्देश देता है।
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